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| 16.10.1999 | 12:00 | Ardena Vilnius | - | Zalgiris Kaunas | 0:3 | |
| 14:00 | FK Nevėžis | - | Banga Gargždai | 1:1 | ||
| 14:00 | FK Kareda Siauliai | - | FK Ekranas | 0:3 | ||
| 14:00 | FK Dainava Alytus | - | FK Atlantas | 1:2 | ||
| 14:30 | FK Zalgiris | - | Inkaras Kaunas | 2:1 |
| » Clasificación | En casa | Fuera de casa | 1.ª vuelta | 2.ª vuelta |
| # | Equipo | P | V | E | D | Goles | DG | Pun. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
Zalgiris Kaunas | 14 | 10 | 3 | 1 | 27:8 | 19 | 33 |
| 2 |
|
FK Atlantas | 14 | 8 | 3 | 3 | 29:20 | 9 | 27 |
| 3 |
|
FK Zalgiris | 14 | 7 | 5 | 2 | 22:8 | 14 | 26 |
| 4 |
|
FK Ekranas | 14 | 7 | 5 | 2 | 20:8 | 12 | 26 |
| 5 |
|
FK Kareda Siauliai | 14 | 7 | 2 | 5 | 24:16 | 8 | 23 |
| 6 |
|
Inkaras Kaunas | 14 | 6 | 4 | 4 | 20:15 | 5 | 22 |
| 7 |
|
FK Nevėžis | 14 | 3 | 5 | 6 | 8:17 | -9 | 14 |
| 8 |
|
Banga Gargždai | 14 | 0 | 7 | 7 | 10:24 | -14 | 9 |
| 9 |
|
Ardena Vilnius | 14 | 1 | 4 | 9 | 5:21 | -16 | 6 |
| 10 |
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FK Dainava Alytus | 14 | 1 | 2 | 11 | 7:35 | -28 | 5 |
