| Super League | Partidos | V | E | D |  |
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| En casa | 5 | 3 | 1 | 1 | 9 | - | 1 |
| Fuera de casa | 3 | - | 2 | 1 | 8 | - | - |
| Total | 8 | 3 | 3 | 2 | 17 | - | 1 |
| Super League | En casa | - | Visitante | |
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Res. |
| 29.12.99 | OFI Heraklion | - | AEP Iraklis FC | 4 | - | - | 1:1 |
| 19.11.00 | AEP Iraklis FC | - | OFI Heraklion | 1 | - | - | 3:0 |
| 03.01.01 | AEP Iraklis FC | - | Olympiacos | 3 | - | - | 2:1 |
| 14.10.01 | Ionikos Nikea | - | AEP Iraklis FC | 3 | - | - | 1:1 |
| 28.09.03 | AO Egaleo | - | AEP Iraklis FC | 1 | - | - | 2:0 |
| 25.10.03 | AEP Iraklis FC | - | Atromitos | 2 | - | 1 | 1:1 |
| 09.11.03 | AEP Iraklis FC | - | Olympiacos | 3 | - | - | 1:3 |
| 21.03.04 | AEP Iraklis FC | - | Aris Saloniki | - | - | - | 6:0 |
Grecia