| Premier Liga | Partidos | V | E | D |  |
 |
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| En casa | 2 | - | 2 | - | 2 | - | - |
| Fuera de casa | 5 | 1 | 1 | 3 | 9 | - | 1 |
| Total | 7 | 1 | 3 | 3 | 11 | - | 1 |
| 1. Division | Partidos | V | E | D | |
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| En casa | 1 | - | 1 | - | 2 | - | - |
| Fuera de casa | - | - | - | - | - | - | - |
| Total | 1 | - | 1 | - | 2 | - | - |
| Relegation Premier Liga | Partidos | V | E | D | |
|
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| En casa | 2 | 2 | - | - | 4 | - | - |
| Fuera de casa | - | - | - | - | - | - | - |
| Total | 2 | 2 | - | - | 4 | - | - |
| Premier Liga | En casa | - | Visitante | |
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Res. |
| 20.11.10 | Sibir Novosibirsk | - | FK Tom Tomsk | 1 | - | 1 | 0:1 |
| 22.06.11 | FK Tom Tomsk | - | FK Rostov | - | - | - | 1:1 |
| 20.08.11 | CSKA Moscú | - | FK Tom Tomsk | 2 | - | - | 3:0 |
| 04.04.14 | Kuban Krasnodar (1928-2018) | - | FK Tom Tomsk | 1 | - | - | 2:0 |
| 26.04.14 | FK Ural | - | FK Tom Tomsk | 1 | - | - | 0:0 |
| 01.10.16 | FK Tom Tomsk | - | FK Ural | 2 | - | - | 1:1 |
| 30.10.16 | Zenit | - | FK Tom Tomsk | 4 | - | - | 1:0 |
| 1. Division | En casa | - | Visitante | |
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Res. |
| 24.03.18 | FK Tom Tomsk | - | Sibir Novosibirsk | 2 | - | - | 1:1 |
| Relegation Premier Liga | En casa | - | Visitante | |
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Res. |
| 27.05.16 | FK Tom Tomsk | - | Kuban Krasnodar (1928-2018) | 4 | - | - | 2:0 |
| 02.06.19 | FK Tom Tomsk | - | FK Ufa | - | - | - | 1:0 |
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