| 1. Jornada | 28.07.2008 | FC Thun | - | FC Wil 1900 | 2:1 |  |
|||
| 2. Jornada | 02.08.2008 | FC Lausanne-Sport | - | FC Thun | 3:1 | ||||
| 3. Jornada | 10.08.2008 | FC Thun | - | FC Lugano | 4:4 | ||||
| 6. Jornada | 29.08.2008 | FC Concordia Basel | - | FC Thun | 1:3 | ||||
| 8. Jornada | 27.09.2008 | FC Wohlen | - | FC Thun | 2:2 | ||||
| 9. Jornada | 06.10.2008 | FC Thun | - | FC Gossau | 4:1 |  |
|||
| 11. Jornada | 03.11.2008 | FC Thun | - | Yverdon Sport FC | 2:4 | ||||
| 12. Jornada | 09.11.2008 | FC Biel/Bienne | - | FC Thun | 3:2 | ||||
| 22. Jornada | 09.04.2009 | FC Thun | - | FC Wohlen | 1:2 | ||||
| 23. Jornada | 17.04.2009 | FC Gossau | - | FC Thun | 4:3 | ||||
| 24. Jornada | 22.04.2009 | FC Thun | - | FC Stade Nyonnais | 1:1 | ||||
| 27. Jornada | 09.05.2009 | FC Locarno | - | FC Thun | 4:1 | ||||
| 30. Jornada | 30.05.2009 | FC La Chaux-de-Fonds | - | FC Thun | 0:1 |
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