| 16. Jornada | 10.01.2004 | OFI Heraklion | - | Iraklis Saloniki | 2:2 | ||||
| 17. Jornada | 18.01.2004 | Panathinaikos | - | OFI Heraklion | 1:0 | ||||
| 18. Jornada | 25.01.2004 | OFI Heraklion | - | Panionios GSS | 1:1 | ||||
| 19. Jornada | 01.02.2004 | Atromitos | - | OFI Heraklion | 2:1 | ||||
| 20. Jornada | 07.02.2004 | OFI Heraklion | - | Aris Saloniki | 3:0 | ||||
| 21. Jornada | 22.02.2004 | OFI Heraklion | - | Olympiacos | 0:1 | ||||
| 22. Jornada | 29.02.2004 | PAOK Saloniki | - | OFI Heraklion | 2:0 |  |
|||
| 23. Jornada | 13.03.2004 | OFI Heraklion | - | Akratitos Liosion | 2:1 | ||||
| 24. Jornada | 21.03.2004 | AO Proodeftiki | - | OFI Heraklion | 2:0 | ||||
| 25. Jornada | 04.04.2004 | OFI Heraklion | - | Paniliakos Pyrgos | 0:0 | ||||
| 26. Jornada | 18.04.2004 | Skoda Xanthi | - | OFI Heraklion | 1:0 | ||||
| 27. Jornada | 25.04.2004 | AO Egaleo | - | OFI Heraklion | 1:0 | ||||
| 29. Jornada | 16.05.2004 | AEK Athen | - | OFI Heraklion | 2:2 | ||||
| 30. Jornada | 22.05.2004 | OFI Heraklion | - | Ionikos Nikea | 1:2 |
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