| 3. Jornada | 21.05.2016 | Real Garcilaso | - | Universidad San Martín | 1:0 | ||||
| 4. Jornada | 27.05.2016 | Universidad San Martín | - | Alianza Atlético | 2:1 |  |
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| 5. Jornada | 29.06.2016 | Alianza Lima | - | Universidad San Martín | 3:0 | ||||
| 6. Jornada | 01.07.2016 | Universidad San Martín | - | Unión Comercio | 1:1 | ||||
| 7. Jornada | 06.07.2016 | César Vallejo | - | Universidad San Martín | 2:2 | ||||
| 8. Jornada | 10.07.2016 | FBC Melgar | - | Universidad San Martín | 1:0 | ||||
| 9. Jornada | 16.07.2016 | Universidad San Martín | - | Sporting Cristal | 1:2 | ||||
| 10. Jornada | 19.07.2016 | Universidad Técnica | - | Universidad San Martín | 3:1 | ||||
| 11. Jornada | 25.07.2016 | Universidad San Martín | - | Ayacucho FC | 1:1 | |
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| 12. Jornada | 31.07.2016 | Juan Aurich | - | Universidad San Martín | 1:3 |  |
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| 13. Jornada | 05.08.2016 | Universidad San Martín | - | Universitario de Deportes | 3:1 | ||||
| 14. Jornada | 07.08.2016 | Defensor La Bocana | - | Universidad San Martín | 2:1 | |
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