| 14. Jornada | 01.12.2008 | FC St. Gallen | - | FC Lugano | 2:1 | ||||
| 15. Jornada | 07.12.2008 | FC Lugano | - | Yverdon Sport FC | 2:0 | ||||
| 17. Jornada | 28.02.2009 | FC Lugano | - | FC Thun | 3:1 | ||||
| 18. Jornada | 08.03.2009 | FC Gossau | - | FC Lugano | 0:1 | ||||
| 19. Jornada | 16.03.2009 | FC Lugano | - | FC Wil 1900 | 0:2 | ||||
| 20. Jornada | 22.03.2009 | FC Lugano | - | FC Wohlen | 2:0 | ||||
| 26. Jornada | 02.05.2009 | FC Lugano | - | FC Stade Nyonnais | 4:0 | ||||
| 27. Jornada | 11.05.2009 | FC Concordia Basel | - | FC Lugano | 2:3 | ||||
| 28. Jornada | 16.05.2009 | FC Lugano | - | Servette FC | 0:1 |  |
|||
| 29. Jornada | 25.05.2009 | FC Lugano | - | FC St. Gallen | 3:1 | ||||
| 30. Jornada | 30.05.2009 | Yverdon Sport FC | - | FC Lugano | 2:1 |
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