| 1. Jornada | 10.09.2016 | Atalanta [Juvenil] | - | Frosinone [Juvenil] | 3:2 | ||||
| 2. Jornada | 17.09.2016 | FC Crotone [Juvenil] | - | Atalanta [Juvenil] | 2:3 | ||||
| 3. Jornada | 23.09.2016 | Palermo [Juvenil] | - | Atalanta [Juvenil] | 1:1 | ||||
| 4. Jornada | 01.10.2016 | Atalanta [Juvenil] | - | Novara Calcio [Juvenil] | 3:0 | ||||
| 6. Jornada | 22.10.2016 | Atalanta [Juvenil] | - | Bolonia [Juvenil] | 4:2 | ||||
| 7. Jornada | 05.11.2016 | Cagliari Calcio [Juvenil] | - | Atalanta [Juvenil] | 0:1 | ||||
| 9. Jornada | 26.11.2016 | Virtus Entella [Juvenil] | - | Atalanta [Juvenil] | 3:1 | ||||
| 15. Jornada | 28.01.2017 | Atalanta [Juvenil] | - | FC Crotone [Juvenil] | 3:0 | ||||
| 17. Jornada | 11.02.2017 | Novara Calcio [Juvenil] | - | Atalanta [Juvenil] | 0:3 | ||||
| 18. Jornada | 18.02.2017 | Atalanta [Juvenil] | - | Génova [Juvenil] | 5:1 | ||||
| 19. Jornada | 25.02.2017 | Bolonia [Juvenil] | - | Atalanta [Juvenil] | 1:2 | ||||
| 21. Jornada | 11.03.2017 | Ternana Calcio [Juvenil] | - | Atalanta [Juvenil] | 0:1 | ||||
| 22. Jornada | 01.04.2017 | Atalanta [Juvenil] | - | Virtus Entella [Juvenil] | 2:2 | ||||
| 26. Jornada | 13.05.2017 | Atalanta [Juvenil] | - | US Salernitana 1919 [Juvenil] | 7:0 |  |
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