| 16. Jornada | 07.11.2009 | Wacker Burghausen | - | Bayern Múnich II | 2:1 | ||||
| 19. Jornada | 05.12.2009 | VfL Osnabrück | - | Wacker Burghausen | 2:1 | ||||
| 29. Jornada | 20.03.2010 | Dynamo Dresden | - | Wacker Burghausen | 1:0 | ||||
| 24. Jornada | 24.03.2010 | Wacker Burghausen | - | Werder Bremen II | 1:1 | ||||
| 30. Jornada | 27.03.2010 | Wacker Burghausen | - | 1. FC Heidenheim 1846 | 1:3 | ||||
| 31. Jornada | 31.03.2010 | Wuppertaler SV | - | Wacker Burghausen | 1:2 | ||||
| 32. Jornada | 03.04.2010 | Wacker Burghausen | - | Stuttgart II | 3:0 | ||||
| 27. Jornada | 07.04.2010 | SpVgg Unterhaching | - | Wacker Burghausen | 1:1 | ||||
| 33. Jornada | 10.04.2010 | SV Wehen Wiesbaden | - | Wacker Burghausen | 3:1 | ||||
| 34. Jornada | 14.04.2010 | Wacker Burghausen | - | SV Sandhausen | 5:2 | ||||
| 35. Jornada | 17.04.2010 | Bayern Múnich II | - | Wacker Burghausen | 2:0 | ||||
| 36. Jornada | 24.04.2010 | Wacker Burghausen | - | Erzgebirge Aue | 0:2 |  |
|||
| 28. Jornada | 27.04.2010 | Wacker Burghausen | - | FC Carl Zeiss Jena | 2:3 |
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