| 1. Jornada | 26.07.2008 | FC Biel/Bienne | - | FC Schaffhausen | 4:1 | ||||
| 2. Jornada | 02.08.2008 | FC Schaffhausen | - | FC Locarno | 2:1 | ||||
| 3. Jornada | 10.08.2008 | Servette FC | - | FC Schaffhausen | 1:2 | ||||
| 4. Jornada | 18.08.2008 | FC Schaffhausen | - | FC La Chaux-de-Fonds | 1:1 | ||||
| 5. Jornada | 23.08.2008 | FC Thun | - | FC Schaffhausen | 0:3 | ||||
| 6. Jornada | 30.08.2008 | FC Schaffhausen | - | FC Wil 1900 | 1:3 | ||||
| 7. Jornada | 13.09.2008 | FC Lausanne-Sport | - | FC Schaffhausen | 3:3 | ||||
| 8. Jornada | 29.09.2008 | FC Schaffhausen | - | FC St. Gallen | 0:1 | ||||
| 10. Jornada | 26.10.2008 | FC Schaffhausen | - | FC Gossau | 5:0 |  |
|||
| 12. Jornada | 09.11.2008 | FC Schaffhausen | - | FC Winterthur | 3:0 | ||||
| 13. Jornada | 16.11.2008 | FC Schaffhausen | - | FC Wohlen | 2:2 | ||||
| 14. Jornada | 29.11.2008 | FC Stade Nyonnais | - | FC Schaffhausen | 3:1 |
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