| 1. Jornada | 30.08.2003 | Almería | - | Atlético Malagueño | 3:2 | ||||
| 2. Jornada | 06.09.2003 | Atlético Malagueño | - | Cádiz CF | 1:3 | ||||
| 3. Jornada | 13.09.2003 | Atlético Malagueño | - | Getafe | 1:1 | ||||
| 4. Jornada | 21.09.2003 | Alavés | - | Atlético Malagueño | 1:0 | ||||
| 5. Jornada | 28.09.2003 | Atlético Malagueño | - | Algeciras CF | 0:0 | ||||
| 6. Jornada | 04.10.2003 | RC Recreativo | - | Atlético Malagueño | 0:0 | ||||
| 8. Jornada | 19.10.2003 | UD Salamanca | - | Atlético Malagueño | 1:1 | ||||
| 9. Jornada | 26.10.2003 | Atlético Malagueño | - | Las Palmas | 0:1 | ||||
| 10. Jornada | 02.11.2003 | Levante | - | Atlético Malagueño | 1:0 | ||||
| 11. Jornada | 09.11.2003 | Atlético Malagueño | - | Xerez CD | 5:2 |  |
|||
| 12. Jornada | 16.11.2003 | Polideportivo Ejido | - | Atlético Malagueño | 1:2 | ||||
| 13. Jornada | 24.11.2003 | Atlético Malagueño | - | Terrassa FC | 1:3 |  |
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| 15. Jornada | 07.12.2003 | Atlético Malagueño | - | Elche | 1:1 | ||||
| 17. Jornada | 20.12.2003 | Atlético Malagueño | - | Numancia | 0:2 | ||||
| 18. Jornada | 04.01.2004 | Ciudad de Murcia | - | Atlético Malagueño | 3:1 | ||||
| 19. Jornada | 11.01.2004 | Atlético Malagueño | - | Eibar | 1:0 | |
 |
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| 20. Jornada | 18.01.2004 | Tenerife | - | Atlético Malagueño | 0:1 |
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