| 4. Jornada | 11.09.2016 | Fortuna Düsseldorf | - | SpVgg Greuther Fürth | 1:1 | ||||
| 5. Jornada | 17.09.2016 | 1. FC Heidenheim 1846 | - | Fortuna Düsseldorf | 2:0 | ||||
| 6. Jornada | 20.09.2016 | Fortuna Düsseldorf | - | VfL Bochum | 3:0 | ||||
| 7. Jornada | 23.09.2016 | Eintracht Braunschweig | - | Fortuna Düsseldorf | 2:1 | ||||
| 8. Jornada | 01.10.2016 | Fortuna Düsseldorf | - | Karlsruher SC | 1:1 | ||||
| 10. Jornada | 21.10.2016 | Fortuna Düsseldorf | - | Arminia Bielefeld | 4:0 |  |
|||
| 12. Jornada | 04.11.2016 | Fortuna Düsseldorf | - | Dynamo Dresden | 0:3 | ||||
| 14. Jornada | 25.11.2016 | Fortuna Düsseldorf | - | Hannover | 2:2 | ||||
| 15. Jornada | 04.12.2016 | Würzburger Kickers | - | Fortuna Düsseldorf | 0:0 | ||||
| 16. Jornada | 09.12.2016 | Fortuna Düsseldorf | - | 1. FC Nürnberg | 0:2 | ||||
| 18. Jornada | 27.01.2017 | Fortuna Düsseldorf | - | SV Sandhausen | 0:3 | ||||
| 20. Jornada | 10.02.2017 | Fortuna Düsseldorf | - | 1. FC Kaiserslautern | 1:1 | ||||
| 31. Jornada | 30.04.2017 | Hannover | - | Fortuna Düsseldorf | 1:0 |  |
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