| 11. Jornada | 03.09.2016 | Sibir Novosibirsk | - | Shinnik Yaroslavl | 1:1 | ||||
| 15. Jornada | 02.10.2016 | Sibir Novosibirsk | - | Baltika Kaliningrad | 1:1 | ||||
| 19. Jornada | 30.10.2016 | Sibir Novosibirsk | - | Luch-Energiya Vladivostok | 0:0 | ||||
| 21. Jornada | 09.11.2016 | Sibir Novosibirsk | - | FK Tambov | 2:0 | ||||
| 22. Jornada | 13.11.2016 | SKA-Khabarovsk | - | Sibir Novosibirsk | 2:0 | ||||
| 23. Jornada | 19.11.2016 | Sibir Novosibirsk | - | FK Khimki | 1:0 |  |
|||
| 24. Jornada | 26.11.2016 | Sibir Novosibirsk | - | FK Neftekhimik | 2:1 | ||||
| 25. Jornada | 08.03.2017 | Mordovia Saransk | - | Sibir Novosibirsk | 0:0 | ||||
| 26. Jornada | 12.03.2017 | Sibir Novosibirsk | - | Kuban Krasnodar (1928-2018) | 0:0 | ||||
| 27. Jornada | 19.03.2017 | Fakel Voronezh | - | Sibir Novosibirsk | 2:0 | ||||
| 28. Jornada | 26.03.2017 | Sibir Novosibirsk | - | Sokol Saratov | 1:0 | |
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| 33. Jornada | 23.04.2017 | Baltika Kaliningrad | - | Sibir Novosibirsk | 1:1 | ||||
| 34. Jornada | 29.04.2017 | Sibir Novosibirsk | - | Zenit 2 | 1:1 |  |
|||
| 35. Jornada | 06.05.2017 | Volgar Astrakhan | - | Sibir Novosibirsk | 4:0 | ||||
| 36. Jornada | 10.05.2017 | Sibir Novosibirsk | - | Spartak Nalchik | 1:0 |
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