| 1. Jornada | 23.07.2016 | FC Milsami | - | FC Saxan | 2:0 |  |
|||
| 2. Jornada | 31.07.2016 | FC Zimbru | - | FC Milsami | 1:0 | ||||
| 3. Jornada | 06.08.2016 | FC Milsami | - | Dacia Chişinău | 1:0 | ||||
| 5. Jornada | 20.08.2016 | FC Academia UTM | - | FC Milsami | 0:4 | ||||
| 7. Jornada | 10.09.2016 | FC Sheriff | - | FC Milsami | 2:0 | ||||
| 9. Jornada | 25.09.2016 | FC Zaria | - | FC Milsami | 0:2 | ||||
| 10. Jornada | 30.09.2016 | FC Milsami | - | Dinamo-Auto | 4:1 | ||||
| 11. Jornada | 16.10.2016 | FC Milsami | - | CF Ungheni | 4:0 | |
|||
| 13. Jornada | 30.10.2016 | FC Milsami | - | FC Zimbru | 1:0 | ||||
| 14. Jornada | 05.11.2016 | Dacia Chişinău | - | FC Milsami | 1:1 | ||||
| 16. Jornada | 25.11.2016 | FC Milsami | - | FC Academia UTM | 2:0 | ||||
| 17. Jornada | 30.11.2016 | Speranţa Nisporeni | - | FC Milsami | 0:2 | ||||
| 20. Jornada | 24.02.2017 | FC Milsami | - | FC Zaria | 1:2 | ||||
| 21. Jornada | 01.03.2017 | Dinamo-Auto | - | FC Milsami | 0:4 | ||||
| 23. Jornada | 11.03.2017 | FC Sheriff | - | FC Milsami | 5:0 | ||||
| 24. Jornada | 16.03.2017 | FC Milsami | - | Dacia Chişinău | 0:0 |  |
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| 27. Jornada | 09.04.2017 | CS Petrocub | - | FC Milsami | 3:1 |
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