| 18. Jornada | 05.02.2000 | BFC Dynamo | - | 1. FC Magdeburg | 0:2 | ||||
| 19. Jornada | 12.02.2000 | FSV Zwickau | - | BFC Dynamo | 1:1 | ||||
| 20. Jornada | 19.02.2000 | BFC Dynamo | - | Rot-Weiß Erfurt | 1:2 | ||||
| 21. Jornada | 27.02.2000 | Hertha II | - | BFC Dynamo | 3:1 | ||||
| 25. Jornada | 26.03.2000 | VFC Plauen | - | BFC Dynamo | 2:1 | ||||
| 27. Jornada | 11.04.2000 | Erzgebirge Aue | - | BFC Dynamo | 1:0 | ||||
| 28. Jornada | 15.04.2000 | BFC Dynamo | - | FC Carl Zeiss Jena | 0:2 | ||||
| 29. Jornada | 22.04.2000 | 1. FC Union Berlin | - | BFC Dynamo | 2:1 | ||||
| 23. Jornada | 26.04.2000 | Dynamo Dresden | - | BFC Dynamo | 1:1 | ||||
| 30. Jornada | 29.04.2000 | BFC Dynamo | - | Stahl Eisenhüttenstadt | 3:0 |  |
|||
| 31. Jornada | 05.05.2000 | SV Babelsberg 03 | - | BFC Dynamo | 0:2 |  |
|||
| 32. Jornada | 10.05.2000 | BFC Dynamo | - | Dresdner SC | 0:0 | ||||
| 33. Jornada | 13.05.2000 | BFC Dynamo | - | VfB Leipzig | 2:3 |
Bulgaria