| 22. Jornada | 15.12.2012 | Rot-Weiß Erfurt | - | Hallescher FC | 2:1 | ||||
| 23. Jornada | 26.01.2013 | Hallescher FC | - | Stuttgarter Kickers | 1:1 | ||||
| 24. Jornada | 03.02.2013 | SpVgg Unterhaching | - | Hallescher FC | 1:3 | ||||
| 25. Jornada | 09.02.2013 | Hallescher FC | - | SV Babelsberg 03 | 1:0 | ||||
| 26. Jornada | 16.02.2013 | Preußen Münster | - | Hallescher FC | 2:0 | ||||
| 27. Jornada | 23.02.2013 | Hallescher FC | - | Chemnitzer FC | 2:0 | ||||
| 28. Jornada | 03.03.2013 | Darmstadt | - | Hallescher FC | 1:2 | ||||
| 29. Jornada | 10.03.2013 | Hallescher FC | - | Hansa Rostock | 3:1 | ||||
| 30. Jornada | 03.04.2013 | SV Wehen Wiesbaden | - | Hallescher FC | 2:0 | ||||
| 32. Jornada | 06.04.2013 | Hallescher FC | - | Wacker Burghausen | 0:0 | ||||
| 33. Jornada | 13.04.2013 | Stuttgart II | - | Hallescher FC | 3:0 | ||||
| 31. Jornada | 16.04.2013 | Hallescher FC | - | 1. FC Heidenheim 1846 | 0:0 | ||||
| 34. Jornada | 20.04.2013 | Hallescher FC | - | VfL Osnabrück | 1:2 |  |
|||
| 35. Jornada | 27.04.2013 | Arminia Bielefeld | - | Hallescher FC | 2:1 | ||||
| 36. Jornada | 04.05.2013 | Hallescher FC | - | Alemannia Aachen | 1:0 | ||||
| 37. Jornada | 11.05.2013 | Borussia Dortmund II | - | Hallescher FC | 2:2 |
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