| 8. Jornada | 31.08.2012 | SKN St. Pölten | - | FC Blau Weiß Linz | 4:1 | ||||
| 9. Jornada | 14.09.2012 | FC Blau Weiß Linz | - | SV Grödig | 1:3 | ||||
| 17. Jornada | 16.11.2012 | FC Blau Weiß Linz | - | SKN St. Pölten | 2:2 | ||||
| 19. Jornada | 30.11.2012 | FC Blau Weiß Linz | - | TSV Hartberg | 0:1 | ||||
| 21. Jornada | 01.03.2013 | FC Blau Weiß Linz | - | FC Lustenau | 1:1 | ||||
| 22. Jornada | 08.03.2013 | Kapfenberger SV 1919 | - | FC Blau Weiß Linz | 1:0 | ||||
| 23. Jornada | 12.03.2013 | FC Blau Weiß Linz | - | SCR Altach | 1:1 | ||||
| 24. Jornada | 15.03.2013 | SV Horn | - | FC Blau Weiß Linz | 2:0 | ||||
| 28. Jornada | 15.04.2013 | TSV Hartberg | - | FC Blau Weiß Linz | 2:2 | ||||
| 29. Jornada | 19.04.2013 | FC Blau Weiß Linz | - | First Vienna FC | 2:3 | ||||
| 30. Jornada | 26.04.2013 | FC Lustenau | - | FC Blau Weiß Linz | 4:3 | ||||
| 31. Jornada | 30.04.2013 | FC Blau Weiß Linz | - | Kapfenberger SV 1919 | 1:1 |  |
|||
| 32. Jornada | 03.05.2013 | SCR Altach | - | FC Blau Weiß Linz | 2:1 | ||||
| 33. Jornada | 10.05.2013 | FC Blau Weiß Linz | - | SV Horn | 2:1 | ||||
| 34. Jornada | 17.05.2013 | Austria Lustenau | - | FC Blau Weiß Linz | 1:0 |
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