| 18. Jornada | 27.02.2010 | NK Istra 1961 | - | NK Međimurje | 1:2 |  |
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| 19. Jornada | 06.03.2010 | NK Varteks | - | NK Istra 1961 | 0:2 | ||||
| 20. Jornada | 13.03.2010 | NK Istra 1961 | - | NK Croatia Sesvete | 1:0 | ||||
| 21. Jornada | 19.03.2010 | NK Zagreb | - | NK Istra 1961 | 1:1 |  |
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| 22. Jornada | 27.03.2010 | NK Istra 1961 | - | NK Osijek | 1:3 | ||||
| 23. Jornada | 03.04.2010 | HNK Cibalia | - | NK Istra 1961 | 0:0 | ||||
| 24. Jornada | 10.04.2010 | NK Istra 1961 | - | NK Zadar | 2:0 | ||||
| 25. Jornada | 14.04.2010 | Hajduk Split | - | NK Istra 1961 | 1:0 | ||||
| 26. Jornada | 17.04.2010 | NK Istra 1961 | - | Slaven Belupo | 2:0 | ||||
| 27. Jornada | 24.04.2010 | HNK Šibenik | - | NK Istra 1961 | 1:1 | ||||
| 29. Jornada | 08.05.2010 | NK Karlovac | - | NK Istra 1961 | 1:1 | ||||
| 30. Jornada | 13.05.2010 | NK Istra 1961 | - | HNK Rijeka | 2:0 |
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