| 6. Jornada | 11.09.2016 | Benfica B | - | Académico de Viseu | 2:1 | ||||
| 8. Jornada | 21.09.2016 | Benfica B | - | Leixões SC | 1:0 | ||||
| 9. Jornada | 28.09.2016 | SC Olhanense | - | Benfica B | 1:2 | ||||
| 10. Jornada | 02.10.2016 | Benfica B | - | CD Santa Clara | 3:1 | ||||
| 11. Jornada | 19.10.2016 | Portimonense SC | - | Benfica B | 3:0 | ||||
| 15. Jornada | 23.11.2016 | FC Famalicão | - | Benfica B | 0:0 | ||||
| 17. Jornada | 04.12.2016 | Oporto B | - | Benfica B | 1:1 |  |
|||
| 18. Jornada | 10.12.2016 | Académica de Coimbra | - | Benfica B | 2:1 | ||||
| 19. Jornada | 16.12.2016 | Benfica B | - | Sporting CP B | 0:0 | |
|||
| 23. Jornada | 23.01.2017 | Benfica B | - | Varzim SC | 1:2 | |
|||
| 24. Jornada | 28.01.2017 | Gil Vicente | - | Benfica B | 1:1 | ||||
| 28. Jornada | 19.02.2017 | Benfica B | - | SC Freamunde | 2:1 | ||||
| 32. Jornada | 15.03.2017 | Benfica B | - | Portimonense SC | 2:3 | |
|||
| 35. Jornada | 08.04.2017 | Sporting Covilhã | - | Benfica B | 2:0 | ||||
| 36. Jornada | 15.04.2017 | Benfica B | - | FC Famalicão | 2:0 | |
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