| Segunda etapa | 14.07.2016 | KRC Genk | - | FK Budućnost Podgorica | 2:0 | ||||
| Segunda etapa | 21.07.2016 | FK Budućnost Podgorica | - | KRC Genk | 2:4 pn. | ||||
| Tercera ronda | 28.07.2016 | KRC Genk | - | Cork City | 1:0 | ||||
| Tercera ronda | 04.08.2016 | Cork City | - | KRC Genk | 1:2 | ||||
| Playoffs | 18.08.2016 | Lokomotiva Zagreb | - | KRC Genk | 2:2 | ||||
| Playoffs | 25.08.2016 | KRC Genk | - | Lokomotiva Zagreb | 2:0 |
Bélgica