| 2. Jornada | 10.07.2016 | Atlético Junior | - | Independiente Medellín | 1:1 | ||||
| 3. Jornada | 13.07.2016 | Independiente Medellín | - | Envigado FC | 0:1 | ||||
| 4. Jornada | 17.07.2016 | Cortuluá | - | Independiente Medellín | 3:4 |  |
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| 8. Jornada | 14.08.2016 | Independiente Medellín | - | Patriotas FC | 3:0 | ||||
| 9. Jornada | 21.08.2016 | Santa Fe | - | Independiente Medellín | 1:1 | ||||
| 1. Jornada | 04.09.2016 | Independiente Medellín | - | Atlético Bucaramanga | 1:0 | ||||
| 13. Jornada | 19.09.2016 | Independiente Medellín | - | Jaguares de Córdoba | 1:1 | |
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| 14. Jornada | 24.09.2016 | Águilas Doradas | - | Independiente Medellín | 2:2 | |
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| 12. Jornada | 05.10.2016 | Alianza Petrolera | - | Independiente Medellín | 3:1 | ||||
| 16. Jornada | 15.10.2016 | Fortaleza FC | - | Independiente Medellín | 2:1 | ||||
| 20. Jornada | 21.11.2016 | Millonarios | - | Independiente Medellín | 3:1 | |
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