| 5. Jornada | 27.09.2008 | Las Palmas | - | Hércules CF | 1:1 | ||||
| 9. Jornada | 26.10.2008 | Hércules CF | - | Alavés | 3:0 | ||||
| 12. Jornada | 16.11.2008 | Girona | - | Hércules CF | 1:0 |  |
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| 13. Jornada | 22.11.2008 | Hércules CF | - | CD Castellón | 0:0 | |
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| 17. Jornada | 20.12.2008 | Hércules CF | - | Huesca | 3:2 |  |
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| 19. Jornada | 10.01.2009 | Hércules CF | - | Alicante CF | 1:2 | ||||
| 23. Jornada | 07.02.2009 | Rayo | - | Hércules CF | 1:0 | ||||
| 24. Jornada | 14.02.2009 | Hércules CF | - | Levante | 4:2 | ||||
| 25. Jornada | 22.02.2009 | Real Sociedad | - | Hércules CF | 1:2 | ||||
| 26. Jornada | 28.02.2009 | Hércules CF | - | Las Palmas | 4:2 | ||||
| 27. Jornada | 08.03.2009 | Zaragoza | - | Hércules CF | 2:2 | ||||
| 28. Jornada | 15.03.2009 | Hércules CF | - | Real Murcia | 3:2 |  |
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| 30. Jornada | 29.03.2009 | Alavés | - | Hércules CF | 1:3 | ||||
| 36. Jornada | 09.05.2009 | Eibar | - | Hércules CF | 0:1 | |
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