| 1. Jornada | 26.08.2012 | AO Kerkyra | - | Atromitos | 0:2 | ||||
| 2. Jornada | 03.09.2012 | Atromitos | - | PAOK Saloniki | 1:0 | ||||
| 3. Jornada | 16.09.2012 | Platanias Chanion | - | Atromitos | 0:0 | ||||
| 4. Jornada | 24.09.2012 | Panathinaikos | - | Atromitos | 1:1 | ||||
| 5. Jornada | 29.09.2012 | Atromitos | - | Olympiacos | 0:1 | ||||
| 6. Jornada | 06.10.2012 | Veria FC | - | Atromitos | 2:2 | ||||
| 7. Jornada | 21.10.2012 | Atromitos | - | Levadiakos | 0:0 | ||||
| 8. Jornada | 28.10.2012 | PAS Giannina | - | Atromitos | 0:0 | ||||
| 9. Jornada | 03.11.2012 | Atromitos | - | Panthrakikos | 2:1 | ||||
| 10. Jornada | 11.11.2012 | Atromitos | - | Panionios GSS | 1:0 | ||||
| 11. Jornada | 19.11.2012 | Asteras Tripolis | - | Atromitos | 3:0 | ||||
| 12. Jornada | 24.11.2012 | Atromitos | - | Skoda Xanthi | 1:0 | ||||
| 13. Jornada | 01.12.2012 | Aris Saloniki | - | Atromitos | 1:1 | ||||
| 14. Jornada | 08.12.2012 | Atromitos | - | OFI Heraklion | 3:2 | ||||
| 15. Jornada | 16.12.2012 | AEK Athen | - | Atromitos | 1:1 | ||||
| 16. Jornada | 06.01.2013 | Atromitos | - | AO Kerkyra | 2:0 | ||||
| 17. Jornada | 13.01.2013 | PAOK Saloniki | - | Atromitos | 0:0 | ||||
| 18. Jornada | 20.01.2013 | Atromitos | - | Platanias Chanion | 1:0 | ||||
| 19. Jornada | 27.01.2013 | Atromitos | - | Panathinaikos | 1:2 |
Francia