| 2. Jornada | 24.08.2008 | SpVgg Unterhaching II | - | Viktoria Aschaffenburg | 1:2 | ||||
| 3. Jornada | 31.08.2008 | SpVgg Unterhaching II | - | Karlsruher SC II | 2:2 | ||||
| 7. Jornada | 05.10.2008 | SpVgg Unterhaching II | - | 1. FC Eintracht Bamberg | 2:4 | ||||
| 9. Jornada | 25.10.2008 | SpVgg Unterhaching II | - | Hessen Kassel | 1:4 | ||||
| 11. Jornada | 02.11.2008 | SpVgg Unterhaching II | - | SpVgg Greuther Fürth II | 0:1 | ||||
| 13. Jornada | 16.11.2008 | SpVgg Unterhaching II | - | Eintracht Frankfurt II | 0:2 | ||||
| 15. Jornada | 30.11.2008 | SpVgg Unterhaching II | - | 1. FC Heidenheim 1846 | 0:2 | ||||
| 18. Jornada | 15.02.2009 | SpVgg Unterhaching II | - | SV Wehen Wiesbaden II | 0:2 |  |
|||
| 22. Jornada | 18.03.2009 | SC Pfullendorf | - | SpVgg Unterhaching II | 3:1 | ||||
| 23. Jornada | 22.03.2009 | SpVgg Unterhaching II | - | SSV Ulm 1846 | 0:0 | ||||
| 27. Jornada | 26.04.2009 | SpVgg Unterhaching II | - | SC Freiburg II | 1:4 | ||||
| 29. Jornada | 10.05.2009 | SpVgg Unterhaching II | - | Waldhof Mannheim | 1:2 | ||||
| 31. Jornada | 17.05.2009 | SpVgg Unterhaching II | - | SSV Reutlingen | 0:1 |
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