| 5. Jornada | 01.03.2009 | Deportes Tolima | - | Atlético Nacional | 2:1 |  |
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| 6. Jornada | 08.03.2009 | Atlético Nacional | - | Millonarios | 1:0 | ||||
| 7. Jornada | 15.03.2009 | Cúcuta Deportivo | - | Atlético Nacional | 2:2 | ||||
| 8. Jornada | 19.03.2009 | Atlético Huila | - | Atlético Nacional | 3:3 | ||||
| 9. Jornada | 22.03.2009 | Atlético Nacional | - | Independiente Medellín | 0:0 | ||||
| 11. Jornada | 12.04.2009 | Deportivo Pasto | - | Atlético Nacional | 1:1 | ||||
| 12. Jornada | 19.04.2009 | Atlético Nacional | - | Deportivo Cali | 1:2 | |
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| 14. Jornada | 23.04.2009 | Atlético Nacional | - | Boyacá Chicó | 2:1 | ||||
| 13. Jornada | 26.04.2009 | Real Cartagena | - | Atlético Nacional | 1:0 | ||||
| 15. Jornada | 03.05.2009 | Santa Fe | - | Atlético Nacional | 1:1 |
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