| 1. Jornada | 21.08.2016 | CDA Navalcarnero | - | SD Amorebieta | 2:0 | ||||
| 2. Jornada | 28.08.2016 | SD Amorebieta | - | CD Mensajero | 1:1 | ||||
| 3. Jornada | 03.09.2016 | Real Madrid Castilla | - | SD Amorebieta | 3:2 | ||||
| 5. Jornada | 17.09.2016 | Real Unión | - | SD Amorebieta | 1:0 | ||||
| 7. Jornada | 01.10.2016 | SD Amorebieta | - | SD Gernika | 3:1 |  |
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| 8. Jornada | 08.10.2016 | SD Leioa | - | SD Amorebieta | 2:3 | ||||
| 14. Jornada | 12.11.2016 | Bilbao Athletic | - | SD Amorebieta | 0:0 | ||||
| 15. Jornada | 19.11.2016 | SD Amorebieta | - | Barakaldo CF | 2:2 | ||||
| 16. Jornada | 27.11.2016 | Sestao River | - | SD Amorebieta | 1:0 | ||||
| 17. Jornada | 03.12.2016 | SD Amorebieta | - | Arenas de Getxo | 2:2 | |
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| 18. Jornada | 11.12.2016 | UD Logroñés | - | SD Amorebieta | 2:1 | ||||
| 22. Jornada | 21.01.2017 | SD Amorebieta | - | Real Madrid Castilla | 2:2 | ||||
| 23. Jornada | 28.01.2017 | Real Sociedad B | - | SD Amorebieta | 1:0 | ||||
| 25. Jornada | 12.02.2017 | Albacete | - | SD Amorebieta | 1:0 | ||||
| 28. Jornada | 05.03.2017 | CF Fuenlabrada | - | SD Amorebieta | 1:0 | |
España