| 1. Jornada | 12.07.2013 | 1. FC Schweinfurt 05 | - | Würzburger Kickers | 3:1 | ||||
| 13. Jornada | 07.09.2013 | Würzburger Kickers | - | 1. FC Nürnberg II | 4:2 | ||||
| 15. Jornada | 21.09.2013 | Würzburger Kickers | - | Ingolstadt II | 2:2 |  |
|||
| 19. Jornada | 19.10.2013 | Würzburger Kickers | - | SpVgg Bayern Hof | 6:0 | ||||
| 21. Jornada | 02.11.2013 | Bayern Múnich II | - | Würzburger Kickers | 4:3 | ||||
| 22. Jornada | 09.11.2013 | Würzburger Kickers | - | TSV 1896 Rain | 5:2 | ||||
| 27. Jornada | 15.03.2014 | TSV 1860 Rosenheim | - | Würzburger Kickers | 5:1 | ||||
| 28. Jornada | 22.03.2014 | Würzburger Kickers | - | SV Heimstetten | 2:2 | ||||
| 25. Jornada | 01.04.2014 | FC Memmingen | - | Würzburger Kickers | 0:1 | ||||
| 31. Jornada | 12.04.2014 | Würzburger Kickers | - | SV Schalding-Heining | 3:1 | ||||
| 34. Jornada | 16.04.2014 | Ingolstadt II | - | Würzburger Kickers | 0:0 | |
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