| 16. Jornada | 19.02.2012 | FC Vaduz | - | FC Aarau | 3:2 | ||||
| 17. Jornada | 26.02.2012 | FC Aarau | - | FC Lugano | 1:0 | ||||
| 18. Jornada | 05.03.2012 | FC Wohlen | - | FC Aarau | 1:3 |  |
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| 19. Jornada | 10.03.2012 | FC Stade Nyonnais | - | FC Aarau | 2:2 | ||||
| 20. Jornada | 19.03.2012 | FC Aarau | - | FC Locarno | 4:1 | ||||
| 21. Jornada | 24.03.2012 | FC Aarau | - | FC Winterthur | 2:1 | ||||
| 22. Jornada | 30.03.2012 | FC Chiasso | - | FC Aarau | 0:0 | ||||
| 23. Jornada | 09.04.2012 | FC Aarau | - | AC Bellinzona | 2:3 | ||||
| 24. Jornada | 14.04.2012 | SC Kriens | - | FC Aarau | 0:2 | |
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| 26. Jornada | 28.04.2012 | FC Aarau | - | FC Wil 1900 | 1:2 |
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