| 1. Jornada | 27.07.2008 | Atlas Guadalajara | - | Jaguares Chiapas | 5:0 |  |
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| 2. Jornada | 03.08.2008 | Atlas Guadalajara | - | Cruz Azul | 2:4 |  |
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| 4. Jornada | 17.08.2008 | Atlas Guadalajara | - | Club San Luis | 0:1 | |
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| 5. Jornada | 24.08.2008 | Atlante | - | Atlas Guadalajara | 2:2 |  |
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| 6. Jornada | 28.08.2008 | Atlas Guadalajara | - | CF América | 1:1 | |
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| 7. Jornada | 31.08.2008 | Pumas UNAM | - | Atlas Guadalajara | 3:0 | ||||
| 8. Jornada | 14.09.2008 | Atlas Guadalajara | - | Puebla FC | 2:0 | |
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| 9. Jornada | 21.09.2008 | Indios Juárez | - | Atlas Guadalajara | 2:4 | |
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| 10. Jornada | 28.09.2008 | Atlas Guadalajara | - | Deportivo Guadalajara | 0:1 | ||||
| 11. Jornada | 04.10.2008 | UAG Tecos | - | Atlas Guadalajara | 3:1 | |
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| 13. Jornada | 19.10.2008 | Club Necaxa | - | Atlas Guadalajara | 0:1 | |
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| 14. Jornada | 26.10.2008 | Atlas Guadalajara | - | Santos Laguna | 2:1 | |
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| 15. Jornada | 02.11.2008 | Deportivo Toluca | - | Atlas Guadalajara | 4:0 | ||||
| 16. Jornada | 09.11.2008 | Atlas Guadalajara | - | Monarcas Morelia | 2:1 | ||||
| 17. Jornada | 16.11.2008 | CF Pachuca | - | Atlas Guadalajara | 1:1 | |
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