| 10. Jornada | 18.10.2008 | Jahn Regensburg | - | Erzgebirge Aue | 1:4 | ||||
| 12. Jornada | 29.10.2008 | Jahn Regensburg | - | Kickers Emden | 0:1 | ||||
| 13. Jornada | 02.11.2008 | Bayern Múnich II | - | Jahn Regensburg | 2:2 |  |
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| 14. Jornada | 08.11.2008 | Jahn Regensburg | - | Stuttgart II | 1:1 | ||||
| 15. Jornada | 15.11.2008 | Kickers Offenbach | - | Jahn Regensburg | 1:1 | |
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| 21. Jornada | 08.02.2009 | Jahn Regensburg | - | VfR Aalen | 1:0 | |
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| 25. Jornada | 07.03.2009 | Jahn Regensburg | - | Fortuna Düsseldorf | 1:2 |  |
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| 22. Jornada | 10.03.2009 | Werder Bremen II | - | Jahn Regensburg | 2:2 | |
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| 26. Jornada | 14.03.2009 | SpVgg Unterhaching | - | Jahn Regensburg | 1:0 | ||||
| 23. Jornada | 18.03.2009 | Jahn Regensburg | - | SC Paderborn 07 | 0:4 | |
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| 33. Jornada | 24.04.2009 | Stuttgart II | - | Jahn Regensburg | 1:2 | ||||
| 35. Jornada | 09.05.2009 | 1. FC Union Berlin | - | Jahn Regensburg | 2:0 | ||||
| 38. Jornada | 23.05.2009 | Jahn Regensburg | - | Eintracht Braunschweig | 2:0 |
Alemania