| 6. Jornada | 03.09.2016 | Deportivo Cuenca | - | Fuerza Amarilla | 3:2 | ||||
| 7. Jornada | 11.09.2016 | Independiente del Valle | - | Deportivo Cuenca | 0:1 |  |
|||
| 19. Jornada | 19.11.2016 | Club Deportivo River Plate Ecuador | - | Deportivo Cuenca | 2:1 | ||||
| 18. Jornada | 24.11.2016 | Deportivo Cuenca | - | Emelec | 2:2 | ||||
| 20. Jornada | 27.11.2016 | Deportivo Cuenca | - | Mushuc Runa | 3:1 | ||||
| 21. Jornada | 04.12.2016 | Aucas | - | Deportivo Cuenca | 1:0 | ||||
| 22. Jornada | 10.12.2016 | Deportivo Cuenca | - | El Nacional | 1:1 |
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