| 3. Jornada | 13.09.2003 | Iraklis Saloniki | - | AEK Athen | 2:2 |  |
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| 4. Jornada | 21.09.2003 | Ionikos Nikea | - | Iraklis Saloniki | 0:1 | ||||
| 5. Jornada | 28.09.2003 | AO Egaleo | - | Iraklis Saloniki | 2:0 | ||||
| 6. Jornada | 05.10.2003 | Iraklis Saloniki | - | Panathinaikos | 0:1 | |
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| 7. Jornada | 19.10.2003 | Panionios GSS | - | Iraklis Saloniki | 2:1 | |
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| 8. Jornada | 25.10.2003 | Iraklis Saloniki | - | Atromitos | 1:1 |  |
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| 14. Jornada | 14.12.2003 | Paniliakos Pyrgos | - | Iraklis Saloniki | 1:2 | ||||
| 15. Jornada | 21.12.2003 | Iraklis Saloniki | - | Skoda Xanthi | 3:0 | ||||
| 16. Jornada | 10.01.2004 | OFI Heraklion | - | Iraklis Saloniki | 2:2 | |
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| 18. Jornada | 25.01.2004 | AEK Athen | - | Iraklis Saloniki | 4:0 | ||||
| 19. Jornada | 31.01.2004 | Iraklis Saloniki | - | Ionikos Nikea | 2:1 |  |
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| 20. Jornada | 08.02.2004 | Iraklis Saloniki | - | AO Egaleo | 2:1 | |
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