| Grupo C | 04.10.2012 | Bor. Mönchengladbach | - | Fenerbahçe | 2:4 |  |
|||
| Grupo C | 25.10.2012 | AEL Limassol | - | Fenerbahçe | 0:1 |  |
|
||
| Grupo C | 06.12.2012 | Fenerbahçe | - | Bor. Mönchengladbach | 0:3 | ||||
| Segunda etapa | 14.02.2013 | BATE Borisov | - | Fenerbahçe | 0:0 | ||||
| Segunda etapa | 21.02.2013 | Fenerbahçe | - | BATE Borisov | 1:0 | |
|||
| Octavos de final | 14.03.2013 | Fenerbahçe | - | Viktoria Plzeň | 1:1 | ||||
| Cuartos de final | 04.04.2013 | Fenerbahçe | - | Lazio | 2:0 | |
|||
| Cuartos de final | 11.04.2013 | Lazio | - | Fenerbahçe | 1:1 | ||||
| Semifinales | 25.04.2013 | Fenerbahçe | - | Benfica | 1:0 | |
|||
| Semifinales | 02.05.2013 | Benfica | - | Fenerbahçe | 3:1 |
Turquía