| 1. Jornada | 05.03.2016 | JK Nõmme Kalju | - | JK Sillamäe Kalev | 2:0 | ||||
| 2. Jornada | 09.03.2016 | FC Infonet | - | JK Nõmme Kalju | 2:1 | ||||
| 3. Jornada | 12.03.2016 | JK Nõmme Kalju | - | Rakvere JK Tarvas | 3:1 | ||||
| 4. Jornada | 19.03.2016 | JK Nõmme Kalju | - | FC Flora | 2:0 |  |
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| 5. Jornada | 02.04.2016 | FC Levadia | - | JK Nõmme Kalju | 1:1 | ||||
| 6. Jornada | 05.04.2016 | Pärnu Linnameeskond | - | JK Nõmme Kalju | 0:1 | |
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| 7. Jornada | 09.04.2016 | JK Nõmme Kalju | - | JK Narva Trans | 6:0 |  |
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| 8. Jornada | 15.04.2016 | JK Tammeka | - | JK Nõmme Kalju | 0:3 | ||||
| 9. Jornada | 23.04.2016 | JK Nõmme Kalju | - | Paide Linnameeskond | 1:0 | |
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| 17. Jornada | 26.04.2016 | JK Nõmme Kalju | - | FC Infonet | 2:1 | |
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| 11. Jornada | 07.05.2016 | JK Nõmme Kalju | - | JK Tammeka | 2:0 | ||||
| 15. Jornada | 10.05.2016 | FC Flora | - | JK Nõmme Kalju | 0:0 | ||||
| 12. Jornada | 14.05.2016 | JK Narva Trans | - | JK Nõmme Kalju | 1:1 |
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