| 12. Jornada | 09.11.2008 | FC Schaffhausen | - | FC Winterthur | 3:0 |  |
|||
| 14. Jornada | 29.11.2008 | FC Concordia Basel | - | FC Winterthur | 3:3 | ||||
| 16. Jornada | 21.02.2009 | Servette FC | - | FC Winterthur | 0:0 | ||||
| 17. Jornada | 01.03.2009 | FC Winterthur | - | FC La Chaux-de-Fonds | 0:1 | ||||
| 18. Jornada | 08.03.2009 | FC Thun | - | FC Winterthur | 2:4 |  |
|
||
| 19. Jornada | 15.03.2009 | FC Winterthur | - | FC Gossau | 2:1 | |
|||
| 20. Jornada | 21.03.2009 | FC Lausanne-Sport | - | FC Winterthur | 1:1 | ||||
| 21. Jornada | 06.04.2009 | FC Winterthur | - | FC Lugano | 2:2 |  |
|||
| 26. Jornada | 02.05.2009 | FC Winterthur | - | FC Schaffhausen | 1:3 | |
|||
| 27. Jornada | 09.05.2009 | FC Stade Nyonnais | - | FC Winterthur | 2:1 | ||||
| 28. Jornada | 16.05.2009 | FC Locarno | - | FC Winterthur | 1:4 | |
|
||
| 30. Jornada | 30.05.2009 | FC St. Gallen | - | FC Winterthur | 3:2 |
Kosovo
