| 1. Jornada | 15.08.2020 | AC Bellinzona | - | FC Rapperswil-Jona | 1:1 | ||||
| 2. Jornada | 19.08.2020 | FC Rapperswil-Jona | - | FC Breitenrain Bern | 2:1 | ||||
| 3. Jornada | 22.08.2020 | FC Basel 1893 II | - | FC Rapperswil-Jona | 2:0 | ||||
| 4. Jornada | 29.08.2020 | SC Brühl | - | FC Rapperswil-Jona | 1:1 | ||||
| 5. Jornada | 05.09.2020 | FC Rapperswil-Jona | - | SC Cham | 0:1 | ||||
| 6. Jornada | 12.09.2020 | FC Sion II | - | FC Rapperswil-Jona | 3:2 | ||||
| 7. Jornada | 19.09.2020 | FC Rapperswil-Jona | - | FC Black Stars Basel | 5:1 | ||||
| 8. Jornada | 26.09.2020 | FC Köniz | - | FC Rapperswil-Jona | 1:6 |  |
|||
| 9. Jornada | 03.10.2020 | FC Rapperswil-Jona | - | SC YF/Juventus Zürich | 5:1 | ||||
| 10. Jornada | 10.10.2020 | Etoile Carouge FC | - | FC Rapperswil-Jona | 1:2 | |
 |
||
| 11. Jornada | 17.10.2020 | FC Rapperswil-Jona | - | FC Stade Nyonnais | 0:2 | ||||
| 12. Jornada | 24.10.2020 | FC Zürich II | - | FC Rapperswil-Jona | 1:4 | |
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| 14. Jornada | 17.04.2021 | Yverdon Sport FC | - | FC Rapperswil-Jona | 3:0 | ||||
| 15. Jornada | 24.04.2021 | FC Rapperswil-Jona | - | FC Bavois | 1:1 |
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