| 6. Jornada | 19.10.2008 | PAOK Saloniki | - | Panathinaikos | 0:0 | ||||
| 7. Jornada | 26.10.2008 | Panathinaikos | - | Iraklis Saloniki | 2:2 |  |
|||
| 4. Jornada | 29.10.2008 | Panathinaikos | - | Ergotelis | 2:3 | ||||
| 8. Jornada | 01.11.2008 | Panionios GSS | - | Panathinaikos | 1:2 | ||||
| 9. Jornada | 09.11.2008 | Panathinaikos | - | Olympiacos | 0:0 | ||||
| 10. Jornada | 15.11.2008 | AE Lárissa | - | Panathinaikos | 1:1 | ||||
| 13. Jornada | 06.12.2008 | Skoda Xanthi | - | Panathinaikos | 1:2 | ||||
| 16. Jornada | 04.01.2009 | Panathinaikos | - | AEK Athen | 0:0 | ||||
| 17. Jornada | 10.01.2009 | Panthrakikos | - | Panathinaikos | 1:3 | |
|||
| 18. Jornada | 18.01.2009 | Panathinaikos | - | Aris Saloniki | 4:0 | ||||
| 19. Jornada | 24.01.2009 | Ergotelis | - | Panathinaikos | 1:0 | ||||
| 21. Jornada | 08.02.2009 | Panathinaikos | - | PAOK Saloniki | 3:0 | |
|||
| 22. Jornada | 15.02.2009 | Iraklis Saloniki | - | Panathinaikos | 0:0 | ||||
| 30. Jornada | 26.04.2009 | Panathinaikos | - | OFI Heraklion | 3:1 | |
Grecia