| 4. Jornada | 16.07.2016 | Once Caldas | - | Águilas Doradas | 1:2 | ||||
| 5. Jornada | 23.07.2016 | Águilas Doradas | - | Boyacá Chicó | 2:1 |  |
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| 6. Jornada | 31.07.2016 | Millonarios | - | Águilas Doradas | 0:0 | |
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| 7. Jornada | 07.08.2016 | Águilas Doradas | - | Atlético Bucaramanga | 2:3 |  |
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| 11. Jornada | 10.09.2016 | Cortuluá | - | Águilas Doradas | 0:1 | ||||
| 12. Jornada | 15.09.2016 | Águilas Doradas | - | La Equidad | 4:0 | |
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| 13. Jornada | 18.09.2016 | Atlético Huila | - | Águilas Doradas | 1:2 | ||||
| 14. Jornada | 24.09.2016 | Águilas Doradas | - | Independiente Medellín | 2:2 | ||||
| 15. Jornada | 30.09.2016 | Patriotas FC | - | Águilas Doradas | 0:1 | ||||
| 3. Jornada | 09.10.2016 | Águilas Doradas | - | Atlético Nacional | 1:1 | ||||
| 16. Jornada | 17.10.2016 | Águilas Doradas | - | Santa Fe | 0:4 | ||||
| 17. Jornada | 23.10.2016 | Deportivo Pasto | - | Águilas Doradas | 0:1 | |
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| 19. Jornada | 06.11.2016 | Jaguares de Córdoba | - | Águilas Doradas | 1:0 | |
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