| 3. Jornada | 26.07.2009 | Real Cartagena | - | Independiente Medellín | 1:3 |  |
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| 4. Jornada | 02.08.2009 | Independiente Medellín | - | Boyacá Chicó | 1:0 | |
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| 5. Jornada | 09.08.2009 | Santa Fe | - | Independiente Medellín | 0:3 | ||||
| 6. Jornada | 16.08.2009 | Independiente Medellín | - | Envigado FC | 4:2 | |
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| 7. Jornada | 24.08.2009 | Atlético Huila | - | Independiente Medellín | 0:2 | |
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| 8. Jornada | 31.08.2009 | Deportivo Pereira | - | Independiente Medellín | 1:0 | ||||
| 9. Jornada | 13.09.2009 | Independiente Medellín | - | Atlético Nacional | 3:1 | ||||
| 10. Jornada | 20.09.2009 | Independiente Medellín | - | La Equidad | 1:0 | ||||
| 11. Jornada | 27.09.2009 | América de Cali | - | Independiente Medellín | 1:2 | |
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| 12. Jornada | 05.10.2009 | Independiente Medellín | - | Atlético Junior | 1:0 | ||||
| 13. Jornada | 18.10.2009 | Deportes Quindío | - | Independiente Medellín | 1:2 | |
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| 15. Jornada | 25.10.2009 | Millonarios | - | Independiente Medellín | 3:0 | |
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| 16. Jornada | 01.11.2009 | Independiente Medellín | - | Cúcuta Deportivo | 2:1 | |
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| 17. Jornada | 08.11.2009 | Atlético Nacional | - | Independiente Medellín | 0:0 | |
Colombia
