| Primera etapa | 15.09.1998 | Sigma Olomouc | - | Marsella | 2:2 | ||||
| Primera etapa | 29.09.1998 | Marsella | - | Sigma Olomouc | 4:0 | ||||
| Segunda etapa | 20.10.1998 | Werder Bremen | - | Marsella | 1:1 |  |
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| Segunda etapa | 03.11.1998 | Marsella | - | Werder Bremen | 3:2 | |
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| Octavos de final | 24.11.1998 | Mónaco | - | Marsella | 2:2 |  |
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| Cuartos de final | 02.03.1999 | Marsella | - | Celta | 2:1 | |
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| Cuartos de final | 16.03.1999 | Celta | - | Marsella | 0:0 | ||||
| Semifinales | 06.04.1999 | Marsella | - | Bolonia | 0:0 | ||||
| Semifinales | 20.04.1999 | Bolonia | - | Marsella | 1:1 | ||||
| Final | 12.05.1999 | Parma AC | - | Marsella | 3:0 |
Francia