| 1. Jornada | 09.07.2016 | Club Nacional | - | Deportivo Capiatá | 2:2 |  |
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| 3. Jornada | 21.07.2016 | Club Nacional | - | Sol de América | 2:1 | |
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| 4. Jornada | 26.07.2016 | Club Nacional | - | Sportivo Luqueño | 1:2 | ||||
| 5. Jornada | 31.07.2016 | Libertad | - | Club Nacional | 3:0 | ||||
| 7. Jornada | 15.08.2016 | Guaraní | - | Club Nacional | 1:0 | ||||
| 14. Jornada | 15.10.2016 | Sol de América | - | Club Nacional | 0:1 | |
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| 15. Jornada | 24.10.2016 | Sportivo Luqueño | - | Club Nacional | 2:1 | |
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| 16. Jornada | 30.10.2016 | Club Nacional | - | Libertad | 1:2 | ||||
| 19. Jornada | 27.11.2016 | Club Olimpia | - | Club Nacional | 2:1 | ||||
| 20. Jornada | 04.12.2016 | Club Nacional | - | Club Rubio Ñu | 3:1 |
Paraguay