| 5. Jornada | 28.02.2016 | Club Deportivo River Plate Ecuador | - | Deportivo Cuenca | 1:3 | ||||
| 7. Jornada | 12.03.2016 | Universidad Catolica | - | Deportivo Cuenca | 2:2 | ||||
| 8. Jornada | 19.03.2016 | Deportivo Cuenca | - | Aucas | 2:2 | ||||
| 9. Jornada | 26.03.2016 | Mushuc Runa | - | Deportivo Cuenca | 0:1 | ||||
| 10. Jornada | 02.04.2016 | Deportivo Cuenca | - | Barcelona | 1:2 | ||||
| 11. Jornada | 10.04.2016 | LDU Quito | - | Deportivo Cuenca | 0:1 |  |
|||
| 14. Jornada | 08.05.2016 | Deportivo Cuenca | - | Mushuc Runa | 1:0 | ||||
| 15. Jornada | 14.05.2016 | Aucas | - | Deportivo Cuenca | 1:2 |  |
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| 22. Jornada | 23.07.2016 | Deportivo Cuenca | - | Independiente del Valle | 1:0 |
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