| Primera etapa | 04.02.2016 | César Vallejo | - | São Paulo FC | 1:1 | ||||
| Primera etapa | 11.02.2016 | São Paulo FC | - | César Vallejo | 1:0 | ||||
| Grupo 1 | 17.02.2016 | São Paulo FC | - | The Strongest | 0:1 | ||||
| Grupo 1 | 10.03.2016 | River Plate | - | São Paulo FC | 1:1 |  |
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| Grupo 1 | 16.03.2016 | Trujillanos FC | - | São Paulo FC | 1:1 | |
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| Grupo 1 | 06.04.2016 | São Paulo FC | - | Trujillanos FC | 6:0 | ||||
| Grupo 1 | 14.04.2016 | São Paulo FC | - | River Plate | 2:1 | ||||
| Grupo 1 | 22.04.2016 | The Strongest | - | São Paulo FC | 1:1 | ||||
| Octavos de final | 29.04.2016 | São Paulo FC | - | Deportivo Toluca | 4:0 | ||||
| Cuartos de final | 12.05.2016 | São Paulo FC | - | Atlético Mineiro | 1:0 | |
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| Cuartos de final | 19.05.2016 | Atlético Mineiro | - | São Paulo FC | 2:1 |
Brasil
