| 17. Jornada | 30.01.2000 | Skoda Xanthi | - | Ionikos Nikea | 2:1 | ||||
| 19. Jornada | 13.02.2000 | Skoda Xanthi | - | OFI Heraklion | 1:1 | ||||
| 20. Jornada | 21.02.2000 | Skoda Xanthi | - | PS Kalamata | 1:0 | ||||
| 21. Jornada | 27.02.2000 | Panachaiki GE | - | Skoda Xanthi | 1:1 | ||||
| 22. Jornada | 05.03.2000 | Skoda Xanthi | - | AO Proodeftiki | 2:1 |  |
|||
| 23. Jornada | 12.03.2000 | Panionios GSS | - | Skoda Xanthi | 4:0 | ||||
| 24. Jornada | 19.03.2000 | Skoda Xanthi | - | Apollon Smyrnis | 2:0 | ||||
| 25. Jornada | 26.03.2000 | AO Kavala | - | Skoda Xanthi | 1:0 | ||||
| 26. Jornada | 02.04.2000 | Skoda Xanthi | - | AO Trikala | 3:0 | ||||
| 27. Jornada | 12.04.2000 | AEK Athen | - | Skoda Xanthi | 4:1 | ||||
| 28. Jornada | 17.04.2000 | Skoda Xanthi | - | PAOK Saloniki | 1:2 | ||||
| 30. Jornada | 03.05.2000 | Ethnikos Asteras | - | Skoda Xanthi | 1:0 | ||||
| 31. Jornada | 07.05.2000 | Skoda Xanthi | - | Iraklis Saloniki | 3:0 | ||||
| 33. Jornada | 21.05.2000 | Skoda Xanthi | - | Olympiacos | 0:1 | ||||
| 34. Jornada | 28.05.2000 | Ionikos Nikea | - | Skoda Xanthi | 2:1 |
Grecia