| Grupo D | 15.09.2016 | Maccabi Tel Aviv | - | Zenit | 3:4 |  |
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| Grupo D | 29.09.2016 | Zenit | - | AZ Alkmaar | 5:0 | |
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| Grupo D | 20.10.2016 | Dundalk FC | - | Zenit | 1:2 | |
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| Grupo D | 03.11.2016 | Zenit | - | Dundalk FC | 2:1 | |
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| Grupo D | 24.11.2016 | Zenit | - | Maccabi Tel Aviv | 2:0 | ||||
| Grupo D | 08.12.2016 | AZ Alkmaar | - | Zenit | 3:2 | |
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| Dieciseisavos de final | 16.02.2017 | RSC Anderlecht | - | Zenit | 2:0 | ||||
| Dieciseisavos de final | 23.02.2017 | Zenit | - | RSC Anderlecht | 3:1 | |
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