| 1. Jornada | 18.08.2008 | MSV Duisburg | - | Hansa Rostock | 2:2 | ||||
| 2. Jornada | 24.08.2008 | Hansa Rostock | - | Alemannia Aachen | 1:0 | ||||
| 3. Jornada | 01.09.2008 | SC Freiburg | - | Hansa Rostock | 1:0 | ||||
| 4. Jornada | 14.09.2008 | Hansa Rostock | - | Mainz | 2:2 |  |
|||
| 5. Jornada | 19.09.2008 | Rot Weiss Ahlen | - | Hansa Rostock | 2:2 | ||||
| 6. Jornada | 26.09.2008 | Hansa Rostock | - | FC St. Pauli | 3:0 | ||||
| 7. Jornada | 05.10.2008 | Ingolstadt | - | Hansa Rostock | 4:2 |  |
|||
| 11. Jornada | 02.11.2008 | Rot-Weiß Oberhausen | - | Hansa Rostock | 1:0 | ||||
| 12. Jornada | 09.11.2008 | Hansa Rostock | - | VfL Osnabrück | 2:2 | ||||
| 13. Jornada | 17.11.2008 | 1. FC Kaiserslautern | - | Hansa Rostock | 6:0 | ||||
| 16. Jornada | 08.12.2008 | 1. FC Nürnberg | - | Hansa Rostock | 4:0 | ||||
| 18. Jornada | 01.02.2009 | Hansa Rostock | - | MSV Duisburg | 0:1 | ||||
| 19. Jornada | 06.02.2009 | Alemannia Aachen | - | Hansa Rostock | 3:3 | ||||
| 22. Jornada | 27.02.2009 | Hansa Rostock | - | Rot Weiss Ahlen | 0:0 | ||||
| 23. Jornada | 06.03.2009 | FC St. Pauli | - | Hansa Rostock | 3:2 | ||||
| 31. Jornada | 08.05.2009 | TSV 1860 München | - | Hansa Rostock | 3:3 |
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