| 1. Jornada | 16.07.2012 | FC Wohlen | - | FC Aarau | 0:1 |  |
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| 2. Jornada | 22.07.2012 | FC Aarau | - | FC Locarno | 1:1 | |
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| 3. Jornada | 29.07.2012 | FC Aarau | - | FC Chiasso | 0:0 | ||||
| 4. Jornada | 06.08.2012 | FC Vaduz | - | FC Aarau | 5:3 |  |
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| 8. Jornada | 03.09.2012 | AC Bellinzona | - | FC Aarau | 1:2 | ||||
| 9. Jornada | 23.09.2012 | FC Aarau | - | FC Biel/Bienne | 4:1 | ||||
| 10. Jornada | 26.09.2012 | FC Locarno | - | FC Aarau | 0:1 | ||||
| 12. Jornada | 06.10.2012 | FC Aarau | - | FC Wil 1900 | 4:2 | ||||
| 13. Jornada | 20.10.2012 | FC Chiasso | - | FC Aarau | 0:1 | ||||
| 16. Jornada | 18.11.2012 | FC Aarau | - | AC Bellinzona | 0:1 | ||||
| 17. Jornada | 26.11.2012 | FC Winterthur | - | FC Aarau | 0:0 | ||||
| 18. Jornada | 02.12.2012 | FC Aarau | - | FC Vaduz | 2:1 | ||||
| 20. Jornada | 18.02.2013 | FC Lugano | - | FC Aarau | 0:2 | ||||
| 24. Jornada | 16.03.2013 | FC Locarno | - | FC Aarau | 0:3 |
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