| 1. Jornada | 01.08.2003 | SG Wattenscheid 09 | - | FC St. Pauli | 1:1 | ||||
| 2. Jornada | 09.08.2003 | FC St. Pauli | - | Preußen Münster | 1:1 | ||||
| 3. Jornada | 17.08.2003 | FC St. Pauli | - | Dynamo Dresden | 2:2 | ||||
| 5. Jornada | 26.08.2003 | FC St. Pauli | - | Hamburgo II | 3:0 |  |
|||
| 8. Jornada | 20.09.2003 | Chemnitzer FC | - | FC St. Pauli | 1:2 | ||||
| 11. Jornada | 10.10.2003 | FC St. Pauli | - | Borussia Dortmund II | 1:1 | ||||
| 17. Jornada | 22.11.2003 | FC St. Pauli | - | Eintracht Braunschweig | 1:0 |
Alemania