| 4. Jornada | 30.03.2013 | Yokohama F. Marinos | - | FC Tokyo | 3:2 | ||||
| 5. Jornada | 06.04.2013 | FC Tokyo | - | RB Omiya Ardija | 0:1 | ||||
| 12. Jornada | 18.05.2013 | FC Tokyo | - | Shimizu S-Pulse | 2:0 | ||||
| 14. Jornada | 06.07.2013 | FC Tokyo | - | Sanfrecce Hiroshima | 0:1 | ||||
| 15. Jornada | 10.07.2013 | Urawa Red Diamonds | - | FC Tokyo | 2:2 |  |
|||
| 16. Jornada | 13.07.2013 | Albirex Niigata | - | FC Tokyo | 0:3 | ||||
| 17. Jornada | 17.07.2013 | FC Tokyo | - | Ventforet Kofu | 4:1 | ||||
| 20. Jornada | 10.08.2013 | Kawasaki Frontale | - | FC Tokyo | 2:2 | ||||
| 21. Jornada | 17.08.2013 | FC Tokyo | - | Yokohama F. Marinos | 0:2 | ||||
| 23. Jornada | 28.08.2013 | FC Tokyo | - | Sagan Tosu | 2:3 | ||||
| 24. Jornada | 31.08.2013 | Sanfrecce Hiroshima | - | FC Tokyo | 1:2 | ||||
| 26. Jornada | 21.09.2013 | Nagoya Grampus | - | FC Tokyo | 0:2 | ||||
| 27. Jornada | 28.09.2013 | RB Omiya Ardija | - | FC Tokyo | 2:5 | |
|||
| 28. Jornada | 05.10.2013 | FC Tokyo | - | Kashima Antlers | 1:4 | ||||
| 29. Jornada | 19.10.2013 | FC Tokyo | - | Albirex Niigata | 2:0 | ||||
| 32. Jornada | 23.11.2013 | FC Tokyo | - | Shonan Bellmare | 2:1 | ||||
| 33. Jornada | 30.11.2013 | Kashiwa Reysol | - | FC Tokyo | 4:1 |
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