| 3. Jornada | 26.08.2006 | FC 08 Villingen | - | FC Emmendingen | 2:1 | ||||
| 5. Jornada | 10.09.2006 | Stuttgarter Kickers II | - | FC Emmendingen | 1:1 | ||||
| 6. Jornada | 15.09.2006 | FC Emmendingen | - | Bahlinger SC | 0:2 | ||||
| 10. Jornada | 21.10.2006 | FC Emmendingen | - | Heidenheimer SB 1846 | 0:5 |  |
|||
| 19. Jornada | 24.02.2007 | SC Freiburg II | - | FC Emmendingen | 2:0 | ||||
| 20. Jornada | 03.03.2007 | FC Emmendingen | - | FC 08 Villingen | 0:1 | ||||
| 21. Jornada | 10.03.2007 | SV Bonlanden | - | FC Emmendingen | 1:1 | ||||
| 25. Jornada | 04.04.2007 | Hoffenheim II | - | FC Emmendingen | 4:0 | ||||
| 26. Jornada | 09.04.2007 | FC Emmendingen | - | VfR Mannheim | 3:1 | ||||
| 27. Jornada | 14.04.2007 | Heidenheimer SB 1846 | - | FC Emmendingen | 1:0 | ||||
| 30. Jornada | 05.05.2007 | FC Emmendingen | - | SG Sonnenhof Großaspach | 1:0 |  |
|||
| 31. Jornada | 11.05.2007 | SV Sandhausen | - | FC Emmendingen | 1:1 | ||||
| 32. Jornada | 19.05.2007 | TSV Crailsheim | - | FC Emmendingen | 3:0 | ||||
| 33. Jornada | 26.05.2007 | FC Emmendingen | - | FC Nöttingen | 2:0 |
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